Les lacs d'eau douce, constituent des réservoirs vitaux et sources majeures d'eau potable à l'échelle mondiale. Ils jouent un rôle essentiel dans le fonctionnement des processus écologique en soutenant la biodiversité, en régulant le cycle de l’eau et en participant activement aux processus biogéochimiques. Toutefois, le lac Osisko situé à Rouyn-Noranda, en Abitibi-Témiscamingue (Québec) est fortement affecté par des apports historiques de contaminants provenant des parcs à résidus miniers et des activités de la fonderie Horne, entraînant une accumulation importante de métaux et de métalloïdes dans ses sédiments. Bien que l’ampleur de cette contamination soit largement documentée, ses effets sur les communautés microbiennes demeurent encore peu connus, alors même que ces microorganismes jouent un rôle central dans la dégradation de la matière organique, la mobilité des métaux ainsi que les cycles biogéochimiques du soufre et de l'azote. Comprendre la réponse de ces communautés à la pollution est donc essentiel pour évaluer l’état écologique et le potentiel de résilience du lac. Cette étude vise à déterminer comment la contamination métallique a influencé la composition et la dynamique des communautés bactériennes dans les sédiments du lac Osisko. Deux objectifs spécifiques ont été poursuivis : (1) reconstituer l'historique de la contamination en quantifiant les concentrations de métaux lourds (As, Cd, Pb, Cu, Zn) dans une carotte sédimentaire datée au Plomb-210 ; (2) caractériser la structure des communautés bactériennes présentes dans les sédiments afin de comprendre leur évolution en réponse à la contamination. Les résultats géochimiques confirment que les sédiments ont fidèlement enregistré l'histoire de la contamination, avec des pics de concentration en métaux lourds coïncidant avec la période de forte activité minière entre 1927 et 1988. Les analyses de séquençage à haut débit du gène de l'ARNr 16S révèlent une diminution significative de la diversité bactérienne durant cette période, accompagnée d'une restructuration profonde des communautés microbiennes. Les taxons dominants de la période pré-industrielle, tels que les Acidobacteriota et les Alphaproteobacteria, ont été progressivement remplacés par des communautés moins diversifiées, dominées par des taxons tolérants aux métaux et associés à des métabolismes anaérobies, notamment les Clostridia. Dans l’ensemble, cette étude démontre que la contamination métallique historique a laissé une empreinte profonde et durable sur la structure et le fonctionnement de l'écosystème microbien du lac Osisko, soulignant l’importance des communautés microbiennes comme indicateurs sensibles de la perturbation environnementale à long terme.
