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15. Analyse comparative des génomes chloroplastiques de neuf espèces de mélèzes

Responsable

 Mebarek Lamara

Collaborateurs

 Yves Bergeron

Problématique

Les mélèzes sont généralement très proches visuellement, il est donc nécessaire d’obtenir des informations supplémentaires de leurs ADN chloroplastique pour pouvoir les différencier et explorer leurs relations phylogénétiques. 

Objectifs

L'objectif principal de ce projet est d'utiliser le séquençage de nouvelle génération (NGS) pour le séquençage, l'assemblage et l'annotation du génome chloroplastique de sept neuf espèces de mélèzes afin de comprendre l'évolution des génomes des chloroplastes et d'élucider les relations phylogénétiques entre les gymnospermes.

Méthodologie

Séquençage du génome chloroplastique de 9 espèces de mélèze.

Retombées escomptées

Les résultats de ce projet vont nous permettront d’établir les liens de parenté entre ces espèces et construire l’arbre phylogénétique ainsi que de développer des marqueurs moléculaires de type SSR (Simple Sequence Repeats) par la détection de séquences répétitives dans le génome des chloroplastes. 

Applicabilité

Livrables

Avancement

- Analyse des données

Organismes subventionnaires

 MITACS

Financement annuel

15 000 $

Durée

2022-2023

Dernière mise à jour : 2023-05-07 11:47:16